Laboratório de Genética Molecular de Bactérias

O Laboratório de Genética Molecular Bactérias concentra esforços no desenvolvimento de pesquisas científicas e com base tecnológica no estudo de patógenos bacterianos de animais e bactérias de importância biotecnológica, como Streptomyces e Myxococcus. As pesquisas envolvem a investigação de mecanismos de patogenicidade e resistência a antimicrobianos, com ênfase em RNAs reguladores e vesículas de membrana externa, e análise de população de bactérias de interesse agropecuário visando a prospecção de metabólitos secundários e produção de inoculantes bacterianos com ação de promoção de crescimento vegetal e controle de pragas. As pesquisas realizadas no laboratório adotam a iniciativa 3 R’s e assim utiliza Galleria mellonella como modelo alternativo ao uso de animais.

Cooperação internacional:
Imperial College London, Inglaterra/ Reino Unido – Prof. Paul R Langford
University of Portsmouth, Reino Unido – Profa Anastasia Callaghan

Serviços

• Genética de patógenos bacterianos de animais: estudo de determinantes genéticos envolvidos com virulência e resistência a antimicrobianos
Este projeto visa o estudo de população de isolados bacterianos (clínicos ou não) provenientes de suínos, principalmente bactérias da família Enterobacteriaceae e Pasteurellaceae. A pesquisa engloba a identificação dos sorotipos predominantes em animais de produção, sadios e doentes, e no sul e sudeste do Brasil por técnicas sorológicas e moleculares, análise da variabilidade genética entre os sorotipos, identificação e determinação dos mecanismos de resistência a antimicrobianos comumente empregados em campo e isolamento e caracterização de plasmídeos associados à resistência e à virulência.

• Chaperonas de RNA, RNAs pequenos reguladores e Vesículas extracelulares bacterianas em patógenos bacterianos animais
Este projeto visa a caracterização estrutural e funcional de vesículas extracelulares produzidas por bactérias da família Pasteurellaceae e Enterobacteriaceae de importância para suínos, especificamente à respeito da composição de ácidos nucleicos e o papel destes na interação patógeno – hospedeiro; além disso investigar o papel das vesículas extracelulares produzidas como veículo em um novo processo de transferência horizontal de genes, a vesidução. Além disso, investigar o papel da proteína Hfq em diferentes na vesiculação por estas bactérias e identificação de pequenos RNAs reguladores (sRNAs) transportados por vesículas. As metas são estabelecimento de um pipeline eficiente de identificação in silico de sRNAs que possa ser usado em outros patógenos bacterianos da família Pasteurellaceae a partir de diferentes ferramentas de bioinformática, além do estudo de sRNAs que dependem da ligação com a proteína Hfq por ensaios de co-imunoprecipitação e confirmação dos alvos de ligação dos sRNAs (genes alvos), além da obtenção de mutantes sRNA específico com o intuito de obtenção de uma vacina viva atenuada.

• Bioinsumos microbianos para aplicação biotecnológica
Este projeto tem como metas isolar e caracterizar em nível fenotípico e genético, bactérias do gênero Streptomyces e Myxococcus provenientes de rizosfera e composto orgânico proveniente de compostagem. É um projeto de cooperação com o setor privado e com demandas específicas do setor da bananicultura. A partir do isolamento e caracterização de bactérias promissoras são propostas tecnologias para o uso de microrganismos in loco para aplicação em promoção de crescimento vegetal e de controle biológico de pragas no setor.

Serviços

• Identificação fenotípica e molecular microbiana

• Genotipagem molecular de isolados bacterianos de interesse agropecuário

• Ensaios de toxicidade e virulência em modelo alternativo Galleria mellonella

• Análises de PCR quantitativa relativa e absoluta

• Fornecimento de larvas de Galleria mellonella para experimentação

• Análises de antibiograma e determinação de concentração mínima inibitória de agentes antimicrobianos de acordo com o CLSI para patógenos de importância veterinária